در آخرین فهرست 500 ابررايانه برتر دنیا، آمار نشان می‌دهد كه 457 دستگاه از لینوكس استفاده می‌كنند و این یعنی سهم این سیستم عامل 91.4 درصد است. به‌دنبال لینوكس، یونیكس با 30 دستگاه و 6 درصد، سیستم‌‌هاي عامل‌ تركیبی با 11 دستگاه و 2‌/‌2درصد در مقام‌های بعدی قرار دارند. نكته جالب این است كه تنها يك ابررايانه با سیستم عامل ویندوز كار می‌كند، در حالی كه در آخرین آمارگیری، تعداد دستگاه‌های مجهز به این سیستم عامل 4 دستگاه بود.

با بررسی عمیق‌تر در این آمار می‌توان به این نتیجه رسید كه 414 ابررايانه از توزیع‌های سفارشی‌ شده لینوكسی استفاده می‌كنند. سیستم عامل AIX كه متعلق به آی‌بی‌ام است، با فاصله، مقام دوم را در اختیار دارد سپس توزیع‌های لینوكسی همچون سوسه، ردهت و CentOS‌ در مقام‌های بعدی هستند.

اوپن‌سولاریس، سیستم عامل مرده اوراكل نیز تنها یك ابررايانه را مدیریت می‌كند و در انتهای این جدول نیز ویندوز HPC 2008 قرار دارد.

در حالی كه لینوكس كمتر از يك درصد بازار رايانه‌های رومیزی را در اختیار دارد، بخش اعظمی از بازار سرورها در اختیار این سیستم عامل است و بستر اصلی بيشتر سرورهای وب را تشكیل می‌دهد. با اين حال می‌توان نتیجه گرفت كه هر جا سرعت عامل مهمی باشد، لینوكس حرف اول را خواهد زد.